重大平臺(tái):基于Transformer架構(gòu)的小核酸藥物AI設(shè)計(jì)大模型-SuperS Model領(lǐng)先成功應(yīng)用
2025-02-13
2025年2月8日,“第四屆?熱景生物生命科學(xué)青年博士論壇”在北京舉行。此次論壇匯聚了來自首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京安貞醫(yī)院、南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院、中國(guó)科學(xué)院過程工程研究所、北京醫(yī)院、北京大學(xué)以及熱景生物未來技術(shù)研究院等單位眾多青年學(xué)者,共同聚焦生命科學(xué)前沿,分享最新研究成果,交流學(xué)術(shù)思想,為推動(dòng)生命科學(xué)的創(chuàng)新發(fā)展注入了新的活力。
在論壇現(xiàn)場(chǎng),X-gen AI新藥發(fā)現(xiàn)與設(shè)計(jì)中心王愛蘭博士介紹了熱景生物參股子公司堯景基因siRNA藥物AI設(shè)計(jì)大模型:SuperS Model。該模型基于Transformer架構(gòu),是首個(gè)針對(duì)siRNA裸序列及化學(xué)修飾的藥物活性預(yù)測(cè)集成系統(tǒng),目前未見其他公開報(bào)道。經(jīng)過精心開發(fā)與迭代,該系統(tǒng)在小核酸藥物設(shè)計(jì)任務(wù)中展現(xiàn)出卓越性能,核心指標(biāo)達(dá)國(guó)際領(lǐng)先水平,標(biāo)志著堯景基因在AI驅(qū)動(dòng)的核酸藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域進(jìn)入全球領(lǐng)先梯隊(duì)。
SuperS Model依托堯景基因高通量平臺(tái)生成的活性數(shù)據(jù)及AI算法優(yōu)勢(shì),采用“數(shù)據(jù)-特征-架構(gòu)”三維驅(qū)動(dòng)框架。通過多源數(shù)據(jù)訓(xùn)練,深度編碼核酸分子的熱力學(xué)、空間構(gòu)象等深度分子特征,并融合專家經(jīng)驗(yàn),基于Transformer構(gòu)建的專有網(wǎng)絡(luò)架構(gòu),SuperS Model實(shí)現(xiàn)了序列修飾與生物活性的動(dòng)態(tài)關(guān)聯(lián)建模,攻克了基因治療領(lǐng)域快速高效篩選的技術(shù)壁壘。
目前,SuperS Model已成功用于堯景基因的核酸藥物開發(fā)流程,并完成多個(gè)研發(fā)管線候選藥物分子的篩選。與傳統(tǒng)基于經(jīng)驗(yàn)特征的siRNA序列設(shè)計(jì)相比,SuperS Model大幅提升了藥物研發(fā)成功率,可大幅壓縮藥物候選分子的發(fā)現(xiàn)周期。SuperS Model的成功應(yīng)用不僅充分驗(yàn)證了“中國(guó)智造”在生物醫(yī)藥研發(fā)的創(chuàng)新實(shí)力,更為基因治療領(lǐng)域提供了高效的智能化工具。